Vi anbefaler at du alltid bruker siste versjon av nettleseren din.
Bildet viser et HE-farget snitt montert i glass, digitale innfargede og analyserte patologisnitt, histotyping og kodesnutter på en mørk skjerm

Institutt for kreftgenetikk og informatikk

Instituttet forsker innenfor biomedisin og informatikk, med fokus på å anvende informatikk som metode for å gjøre genetiske og epigenetiske studier av kreft. Vi har de siste årene tatt i bruk kunstig intelligens i dette arbeidet.

Vår visjon er å bidra til å styrke Oslo universitetssykehus med kunnskap og kompetanse til beste for behandling av og omsorg for pasienter. I tillegg til betydelig diagnostisk virksomhet søker instituttet å utvikle nye diagnostiske og prognostiske markører for tilpasset behandling av kreft.

Eksterne lenker til instituttets nettsider og prosjektsider 

Instituttet ledes av Tarjei Sveinsgjerd Hveem.

Håvard E. G. Danielsen (1957–2023) grunnla instituttet i 2004 og ledet det frem til sin død i 2023. Danielsen var en pioner og en verdensledende ekspert på digital patologi og kunstig intelligens. I 2022 ble han tildelt Kong Olav Vs Kreftforskningspris fra Kreftforeningen, og "Excellent Researcher Award" fra Oslo universitetssykehus.

Seksjon for kreftcytogenetikk

Utfører rutinediagnostiske analyser og forskningsarbeid innen kreftgenetikk. Analysene som utføres er karyotyping (G-bånd), FISH, og array CGH, samt et utvalg molekylære undersøkelser.

Seksjonen ledes av Francesca Micci. Diagnostikkrelatert arbeid utføres hovedsakelig på enhet for laboratoriediagnostikk der Laila Helene Bergly er enhetsleder.

Seksjon for interfasegenetikk

Seksjonen ledes av Hanne Askautrud, og er svært involvert i instituttets forskningsvirksomhet, i tillegg til diagnostikk. Seksjonen har et diagnostisk tilbud innen DNA ploidi analyse, og analysen utføres på laboratorie for diagnostikk. Laboratorie for diagnostikk er organisert under enhet for laboratorier der Marna Lill Kjæreng er enhetsleder.

Seksjon for anvendt informatikk 

John Arne Nesheim leder seksjonen som arbeider med programvareutvikling, prosjektledelse, drift av datasystemer, digital bildeanalyse, kvalitetssikring, webutvikling og forskningsformidling. Seksjonen har bred kompetanse innen utvikling av systemer for dyp læring via nevrale nett, også omtalt som kunstig intelligens. 

Laboratorievirksomhet

Diagnostikken ved Seksjon for kreftcytogenetikk er fordelt på to ulike laboratorier, ett for hematologiske neoplasier og lymfomer, og ett for solide svulster, for det meste sarkomer. Seksjonen mottar årlig rundt 3000 prøver i året fra Helse Sør-Øst, Helse Midt og Helse Nord, hvorav 8000 – 9000 cytogenetiske analyser gjennomføres. Metodene som utføres er FISH, G-bånd og aCGH.

For bestilling av cytogenetiske analyser se Rekvisisjoner til analyser utført av Seksjonen for kreftcytogenetikk.

Akkreditering

Seksjon for kreftcytogenetikk ble akkreditert 14. mars 2025 av Norsk Akkreditering ihht NS-EN ISO 15189 (TEST 332). Akkrediteringen gjelder alle FISH-analyser.

Akkrediteringsmerket er ikke angitt på seksjonens svarrapport. Seksjonen arbeider mot akkreditering av flere analyser og akkrediteringsmerket vil være å finne på svarrapporten når dette er på plass.

Forventet svartid

Ffuorescens in-situ hybridisering (FISH) 
  • Benmarg, blod og lymfeknute – rutineprøve: 3 uker
  • Benmarg, blod og lymfeknute – hasteprøve: 10 dager
  • Solid svulst – rutineprøve: 3 uker
  • Solid svulst – hasteprøve: 2 uker
G-bånd
  • Benmarg, blod og lymfeknute – rutineprøve: 3 uker
  • Benmarg, blod og lymfeknute – hasteprøve: 12 dager
  • Solid svulst – rutineprøve: 4 uker
  • Solid svulst – hasteprøve: 3 uker
Array-basert komparativ genomisk hybridisering (aCGH)
  • ABL-klassefusjon for A2G pasienter: 14 dager
  • CNA-profil og genetiske avvik for A2G-pasienter: 28 dager
  • Andre akutte leukemier: 28 dager 
  • Rutineprøver: 6 uker

Forventet svartid referer til antall kalenderdager der majoriteten av prøver vil være ferdig besvart. Prøvesvaret kan altså være klart før det oppgitte antall dager.

Avvik fra forventet svartid kan forekomme. Oppgitt svartid kan altså ikke regnes som en garanti for at prøvesvaret er klart i løpet av denne tiden, men målet er at analysen skal være svart ut innenfor ovennevnte antall dager. Det er viktig å være klar over at tiden regnes fra vi mottar prøven ved vår avdeling til vi sender ut svarrapport. Eventuell postgang må legges til disse tidsangivelsene. I forbindelse med ferie og høytider må noe lengre svartider påregnes.

Seksjonen kan kontaktes på telefon: 91 33 05 79

FISH

Interfase-FISH er en målrettet analyse som kun gir kvantitativ informasjon om kromosomregionen/gen den enkelte probe undersøker for. Metoden er dermed ingen erstatning for screening med G-bånd. Metafase-FISH er en målrettet tilleggsanalyse som utføres der man ønsker ytterligere informasjon om cytogenetisk lokalisasjon av spesifikke gen-loci.

Prøver med avvik som overstiger intern cutoff-verdi rapporteres vanligvis som abnorme. Prøver som ikke overstiger intern cutoff-verdi rapporteres vanligvis som normale. Utover dette gjøres en medisinskfaglig tolkning av signalmønsteret.

Et normalt prøvesvar utelukker ikke at det finnes relevante cytogenetiske avvik.

G-bånd

Kromosomanalyse ved G-bånd er en kvantitativ helgenomanalyse. Det er mulig å detektere strukturelle avvik ned til ~5 Mb størrelse. Metoden avhenger av levende celler for dyrkning i kultur. Dersom det er feil/mangler ved prøvetaking og/eller prøveforsendelse vil dette i stor grad kunne påvirke det endelige resultatet. Videre kan det tilsendte prøvemateriale har en utilstrekkelig delingsevne in vitro basert på biologiske egenskaper. Kvaliteten på G-båndspreparatene er avhengige av mange faktorer. For preparater av dårligere kvalitet vil de strukturelle endringene måtte være større enn for preparater av god kvalitet. G-båndsfargingen i det aktuelle område kan tidvis være en begrensing, dersom to segmenter av lik størrelse med lys farge (GC-rike områder) er involvert i en translokasjon vil denne translokasjonen ikke være mulig å detektere ved karyotypering. Et normalt prøvesvar utelukker dermed ikke at det finnes relevante cytogenetiske avvik. Det vil alltid gjøres en medisinskfaglig tolkning basert på tilgjengelig informasjon om pasientens sykdomsforløp/historikk samt annen tilgjengelig informasjon.

Tilbakemelding

Som ledd i kontinuerlig forbedring ønsker vi tilbakemeldinger på våre laboratorietjenester, både fra rekvirenter og pasienter. Henvendelser kan rettes til

Kontakt

Telefon

Administrasjon

22 78 23 20
  • Mandag - Fredag 08:30 - 15:30
  • Lørdag - Søndag STENGT

Seksjon for kreftcytogenetikk (prøvelevering)

91 33 05 79
  • Mandag - Fredag 08:30 - 16:00
  • Lørdag 09:30 - 14:00
  • Søndag STENGT
24.12, 31.12 og onsdag før skjærtorsdag: 08:00-12:00 Helligdager: stengt

Seksjon for interfasegenetikk

22 78 23 35
  • Mandag - Fredag 09:00 - 15:00
  • Lørdag - Søndag STENGT

Postadresse

Oslo universitetssykehus HF, Radiumhospitalet
Institutt for kreftgenetikk og informatikk,
Postboks 4953 Nydalen
0424 Oslo

E-post

hramstad@ous-hf.no
cytogenetikk@radiumhospitalet.no

Slik finner du fram

Oppmøtested

Instituttet holder til i Ullernchausséen 64, ved siden av Radiumhospitalet. Inngang 2A, i 5.–7. etasje.


En stor bygning med en person som sykler

Oslo Cancer Cluster Innovasjonspark

Ullernchausseen 64/66

0379 Oslo

Finn frem