Institutt for kreftgenetikk og informatikk

Seksjon for kreftcytogenetikk

Utfører rutinediagnostiske analyser og forskningsarbeid innen kreftgenetikk. Analysene som utføres er karyotyping (G-bånd), FISH, og array CGH, samt et utvalg molekylære undersøkelser.

Seksjonen ledes av Francesca Micci. Diagnostikkrelatert arbeid utføres hovedsakelig på enhet for laboratoriediagnostikk der Laila Helene Bergly er enhetsleder.

Seksjon for interfasegenetikk

Seksjonen ledes av Hanne Askautrud, og er svært involvert i instituttets forskningsvirksomhet, i tillegg til diagnostikk. Seksjonen har et diagnostisk tilbud innen DNA ploidi analyse, og analysen utføres på laboratorie for diagnostikk. Laboratorie for diagnostikk er organisert under enhet for laboratorier der Marna Lill Kjæreng er enhetsleder.

Seksjon for anvendt informatikk 

John Arne Nesheim leder seksjonen som arbeider med programvareutvikling, prosjektledelse, drift av datasystemer, digital bildeanalyse, kvalitetssikring, webutvikling og forskningsformidling. Seksjonen har bred kompetanse innen utvikling av systemer for dyp læring via nevrale nett, også omtalt som kunstig intelligens. 

Diagnostikken ved Seksjon for kreftcytogenetikk er fordelt på to ulike laboratorier, ett for hematologiske neoplasier og lymfomer, og ett for solide svulster, for det meste sarkomer. Seksjonen mottar årlig rundt 3000 prøver i året fra Helse Sør-Øst, Helse Midt og Helse Nord, hvorav 8000 – 9000 cytogenetiske analyser gjennomføres. Metodene som utføres er FISH, G-bånd og aCGH.

For bestilling av cytogenetiske analyser se Rekvisisjoner til analyser utført av Seksjonen for kreftcytogenetikk.

Akkreditering

Seksjon for kreftcytogenetikk ble akkreditert 14. mars 2025 av Norsk Akkreditering ihht NS-EN ISO 15189 (TEST 332). Akkrediteringen gjelder alle FISH-analyser.

Akkrediteringsmerket er ikke angitt på seksjonens svarrapport. Seksjonen arbeider mot akkreditering av flere analyser og akkrediteringsmerket vil være å finne på svarrapporten når dette er på plass.

Forventet svartid

Ffuorescens in-situ hybridisering (FISH) 

• Benmarg, blod og lymfeknute – rutineprøve: 3 uker
• Benmarg, blod og lymfeknute – hasteprøve: 10 dager
• Solid svulst – rutineprøve: 3 uker
• Solid svulst – hasteprøve: 2 uker

G-bånd

• Benmarg, blod og lymfeknute – rutineprøve: 3 uker
• Benmarg, blod og lymfeknute – hasteprøve: 12 dager
• Solid svulst – rutineprøve: 4 uker
• Solid svulst – hasteprøve: 3 uker

Array-basert komparativ genomisk hybridisering (aCGH)

• ABL-klassefusjon for A2G pasienter: 14 dager
• CNA-profil og genetiske avvik for A2G-pasienter: 28 dager
• Andre akutte leukemier: 28 dager 
• Rutineprøver: 6 uker

Forventet svartid referer til antall kalenderdager der majoriteten av prøver vil være ferdig besvart. Prøvesvaret kan altså være klart før det oppgitte antall dager.

Avvik fra forventet svartid kan forekomme. Oppgitt svartid kan altså ikke regnes som en garanti for at prøvesvaret er klart i løpet av denne tiden, men målet er at analysen skal være svart ut innenfor ovennevnte antall dager. Det er viktig å være klar over at tiden regnes fra vi mottar prøven ved vår avdeling til vi sender ut svarrapport. Eventuell postgang må legges til disse tidsangivelsene. I forbindelse med ferie og høytider må noe lengre svartider påregnes.

Seksjonen kan kontaktes på telefon: 91 33 05 79